ProtLingo: Efficient Protein Language Modeling via Conditional Memory and Expert Routing
arXiv:2609.04793v1 发布名为 ProtLingo 的新型高效蛋白质语言模型框架,该框架通过条件局部记忆和稀疏专家路由机制,在保持 1.5 亿参数规模骨干网络的同时实现了与现有方法相当的性能。ProtLingo 将上下文残基表示映射为特定路线的离散代码,组成中心局部窗口以生成潜在 N-gram 地址,并检索与重复局部序列上下文相关的可重用残差信号;同时,部分前馈块被升级为共享且路由的稀疏混合专家层,仅在激活参数子集时执行依赖残基的计算。在蛋白质适应性预测、FLIP 基准测试及监督接触预测等实验表明,该模型在突变效应预测上具备高参数效率,并保留了长程结构表示能力。