CSIRO发布sBeacon基因组查询架构
发生了什么
据InfoQ中文报道,CSIRO发布Serverless Beacon(sBeacon)架构。该方案结合Amazon S3、Lambda、Athena和DynamoDB实现GA4GH Beacon标准,查询时无需复制大型基因组数据,仅对元数据建索引并通过HTTP字节范围读取VCF文件。CSIRO使用千人基因组计划1号染色体的2504个样本评估,称数据集接入耗时18秒、成本0.00052美元,1万个碱基对查询平均耗时1.52秒、成本0.00013美元。
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不复制海量数据,直接查询 S3:CSIRO 重构基因组分析架构
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